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Secondo la relazione del rapporto di Amnesty International, Patrick Zaki è stato arrestato il 7 febbraio 2020 dagli ufficiali della sicurezza egiziana all’aeroporto di Cairo, in Egitto, quando stava cercando di lasciare il paese per scopi accademici. Amnesty afferma che Patrick Zaki è stato arrestato "in base a accuse pretestuose" e che è stato sottoposto a "torture e trattamenti inumani" durante il suo periodo in detenzione. Amnesty ha anche dichiarato che Patrick Zaki rischia la pena di morte se condannato.
La causa dell’arresto di Patrick Zaki sembra essere legata alla sua attività come studente universitario e attivista dei diritti umani. Secondo il rapporto di Amnesty, Patrick Zaki stava lavorando a una tesi sulle violazioni dei diritti umani in Egitto quando è stato arrestato. Amnesty sostiene che l’arresto di Patrick Zaki è "un attacco alla libertà di espressione" e che le autorità egiziane stanno cercando di "intimorire gli attivisti dei diritti umani".